Este estudo teve como objetivo descrever a histologia gonadal e o ciclo reprodutivo de ostras (Crassostrea brasiliana) nos manguezais da Baía de Guaratuba no sul do Brasil. Os adultos foram coletados mensalmente, entre janeiro de 2010 a abril 2011, em três bancos de reprodutores localizados em zona intermareal. Os animais foram avaliados utilizando-se análises biométricas e histológicas das gônadas. As amostras de tecido gonadal foram processadas de acordo com os procedimentos histotécnicos padrão. Lâminas permanentes foram preparadas usando hematoxilina e eosina de Harris. As ostrasdtambém foram identificadas ao nível de espécie através de um protocolo molecular. As fêmeas (69%) predominaram sobre os machos (26%), com 4% de indivíduos de sexo indeterminado e 1% hermafrodita. Fêmeas maduras foram mais prevalentes em fevereiro, março e dezembro de 2010 e em março de 2011. Os machos maduros foram mais prevalentes em fevereiro e abril de 2010 e em março de 2011. A presença de indivíduos hermafroditas foi esporádica e ostras em estágios imaturos ou repouso sexual foram observadas em apenas algumas coletas entre os meses de maio e outubro de 2010. A reprodução de C. brasiliana na Baía de Guaratuba ocorre de forma intermitente, mas com maior intensidade durante o verão.