O GIA tem se destacado no Brasil tanto na formação e na qualificação de pesquisadores quanto como um núcleo de excelência no desenvolvimento e aplicação de ferramentas técnico-científicas para:
• O estabelecimento de programas de desenvolvimento socioambiental e de resgate cultural;
• A geração de renda junto às comunidades litorâneas tradicionais a partir da pesca, da aquicultura, do turismo e do artesanato;
• O planejamento e apoio à formulação de políticas públicas;
• No zoneamento marinho e continental para a instalação de empreendimentos aquícolas;
• O desenvolvimento de projetos comerciais de aquicultura (produção e o cultivo de organismos aquáticos);
• O manejo e o uso sustentável de recursos aquáticos;
• A avaliação, no monitoramento e na adoção de medidas de mitigação de impactos ambientais;
• A quantificação e valoração de danos ambientais;
• O zoneamento e planejamento de programas de ocupação e desenvolvimento territorial;
• A recuperação de ambientes degradados/alterados;
• A identificação de patologias de organismos aquáticos;
• O desenvolvimento de ferramentas genéticas de última geração para avaliação e resolução de problemas ambientais e sanitários.