Condições Abióticas e efeitos na degradação de DNA ambiental

Por Ana Paula Silva Bertão

Interação da radiação ultravioleta em ambientes límnicos

A exposição aos raios da radiação ultravioleta – UVR, podem atingir a superfície da terra em comprimentos de onda entre 290 a 400nm. A radiação ultravioleta é dividida nas seguintes bandas: UVA onda longa (315–400 nm), UVB onda média (280–315 nm) e UVC onda curta (100–280 nm). Praticamente 99,9 % do UVC e 95% da radiação UVB são absorvidos pela camada protetora de ozônio na estratosfera. A intensidade da radiação UV incidente na superfície terrestre é influenciada por vários fatores, como, estação do ano, hora do dia, a cobertura de nuvens, latitude e altitude, reflexão dos raios na superfície e ozônio estratosférico (McKenzie et al. 2008; Sousa 2013).

Os habitats aquáticos diferem enormemente em sua transparência, algumas substâncias absorventes e dispersantes atenuam a radiação incidente, especialmente em habitats eutrófico de água doce (Callaghan et al. 2004). O material particulado inorgânico, carbono orgânico dissolvido – DOC e carbono orgânico particulado – POC, bem como uma variedade de substâncias húmicas, atenua significativamente a radiação de comprimento de onda curto (Harris et al. 2008). O DOC é bastante resistente à degradação na coluna d’água, mas é facilmente decomposto em subunidades menores pelo UV solar, que pode ser facilmente absorvido pelo bacterioplâncton (Wrona et al. 2006). Como consequência, esse processo diminui a atenuação na coluna d’água, resultando em uma penetração mais profunda da radiação solar (Shindell et al. 1998).

Para entender como a transparência da água interfere na absorção dos raios UV, podemos avaliar a profundidade que estes raios estão alcançando com o uso do disco de Secchi (Esteves 1998). Quanto maior a transparência da água, menor dispersão do campo da luz e maior a medida de profundidade do disco de Secchi. O valor do disco de Secchi é inversamente proporcional à quantidade de compostos orgânicos e inorgânicos no percurso da luz e ao coeficiente de atenuação da irradiância. O desaparecimento do disco de Secchi corresponde à profundidade na qual a radiação da faixa do visível não é mais sensível ao olho humano. A zona fótica pode ser estimada através da transparência do disco de Secchi (Esteves 1998). O desaparecimento do disco de Secchi corresponde a 10% da radiação superficial. O limite inferior da zona eufótica recebe apenas 1% da irradiância daquela recebida na superfície e, abaixo dessa é denominada de zona afótica (Fill and Santos 2001).

Efeito da radiação ultravioleta no eDNA

Os efeitos da radiação UV nos ambientes aquáticos podem variar muito em um mesmo ecossistema, devido a profundidade da água, luminosidade, claridade e quantidade de sólidos suspensos. O dano fotobiológico, causado pelos raios UV, pode incluir efeitos diretos da radiação UV, na qual os fótons são absorvidos por moléculas biológicas, como ácidos nucléicos e proteínas, que sofrem alterações fotoquímicas (Wrona et al. 2006).

O DNA é um dos principais alvos dos danos induzidos por UV em uma variedade de organismos aquáticos, como também de DNA ambiental presente no ecossistema. A radiação UV induz duas das lesões de DNA mutagênicas e citotóxicas mais abundantes, como os dímeros de ciclobutano pirimidina (CPDs) e fotoprodutos de pirimidina pirimidona (6-4PPs) e seus isômeros de valência Dewar (Wrona et al. 2006) (Figura 1). Em especial a UV-B, danifica o DNA ao enrolar e distorcer sua estrutura em forma de escada, causando degradação da fita (Wrona et al. 2006).

Diversos estudos avaliaram a taxa de degradação do eDNA em diferentes organismos. Estes estudos analisaram as principais características ambientais que podem influenciar na degradação do eDNA, entre elas estão como exemplo, a temperatura (Barnes et al. 2014), turbidez da água (Deiner et al. 2017; Stoeckle et al. 2017), acidez (Strickler et al. 2015) e a comunidade bacteriana (Lance et al. 2017)

No estudo de Kasai et al. (2020) com enguias japonesas Anguilla japonica, os resultados mostram que mais da metade da deterioração do eDNA acontece no período de 48 horas, e o decaimento é mais evidente quando a temperatura estava em 30ºC (Figura 2).

No estudo de Eichmiller et al. (2016) com Cyprinus carpio, foi avaliado o efeito da temperatura na degradação do eDNA. O decaimento do DNA da carpa foi exponencial, essa queda foi evidenciada com aumento da temperatura. A menor taxa de decaimento foi observada a 5° C, com um valor de T90 (tempo para redução de 90% da concentração inicial). Diferentemente das temperaturas de 20 a 35º C, onde a degradação foi muito maior.

Importância do estudo da degradação do eDNA

O uso preciso e biologicamente relevante do eDNA como avaliação da presença, abundância e localização dos organismos-alvo requer uma compreensão das taxas de decaimento do eDNA (a redução na quantidade detectável de eDNA) e degradação (alterações físicas na molécula / partícula) em diferentes ambientes (Harrison et al. 2019).

Os processos que podem contribuir para a remoção ou degradação do eDNA em sistemas aquáticos, inicia por uma via primária de decaimento do eDNA, que é a degradação física do tecido e das partículas que compreendem o eDNA. O tecido biológico derramado geralmente começa a se degradar imediatamente de fragmentos de tecido multicelular, para células inteiras, organelas separadas (por exemplo, mitocôndrias) e, eventualmente, para liberar DNA (extracelular), que por sua vez são intensificados são e degradados por enzimas exógenas ou por reações químicas espontâneas (Turner et al. 2014).

Informações sobre degradação do eDNA referentes a temperatura, radiação ultravioleta e comunidade bacteriana devem ser considerados e aplicados em protocolos de armazenamento de amostras de água e em projeto de amostragem de campo para que venham diminuir a degradação de DNA em amostras ambientais (Eichmiller et al. 2016; Harrison et al. 2019).

Bibliografia

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