{"id":12855,"date":"2021-05-12T08:57:18","date_gmt":"2021-05-12T11:57:18","guid":{"rendered":"https:\/\/gia.org.br\/portal\/?p=12855"},"modified":"2021-07-05T16:49:22","modified_gmt":"2021-07-05T19:49:22","slug":"edna-um-breve-historico-da-evolucao-molecular-ambiental","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/gia.org.br\/portal\/edna-um-breve-historico-da-evolucao-molecular-ambiental\/","title":{"rendered":"eDNA: UM BREVE HIST\u00d3RICO DA EVOLU\u00c7\u00c3O MOLECULAR AMBIENTAL"},"content":{"rendered":"\t\t
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Por: Aline Horodesky<\/strong><\/p>

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O estudo de DNA ambiental (eDNA), est\u00e1 baseado na detec\u00e7\u00e3o de mol\u00e9culas de DNA produzidas como subproduto das atividades de uma determinada esp\u00e9cie, como aquelas encontradas em fezes, muco, saliva ou outra fonte de c\u00e9lulas mortas. M\u00e9todos de laborat\u00f3rio podem ser empregados para detectar e quantificar estas mol\u00e9culas, levando a diversos tipos de aplica\u00e7\u00f5es. Uma potencial extens\u00e3o da abordagem de eDNA envolve a detec\u00e7\u00e3o de mais de uma esp\u00e9cie simultaneamente.<\/p>\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/section>\n\t\t\t\t

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Figura 1. Esquema mostrando a detec\u00e7\u00e3o de diferentes esp\u00e9cies a partir de uma amostra ambiental.<\/p>\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/section>\n\t\t\t\t

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A primeira refer\u00eancia ao DNA ambiental remonta a 1987 e diz respeito a um m\u00e9todo para extra\u00e7\u00e3o de DNA microbiano de sedimentos. No entanto, o termo realmente surgiu no in\u00edcio dos anos 2000, principalmente usado pela comunidade de microbiologistas. DNA ambiental refere-se ao DNA que pode ser extra\u00eddo de amostras ambientais (como solo, \u00e1gua ou ar), sem primeiro isolar qualquer organismo-alvo. \u00c9 caracterizado por uma mistura complexa de DNA gen\u00f4mico de muitos organismos diferentes e por poss\u00edvel degrada\u00e7\u00e3o (isto \u00e9, por mol\u00e9culas de DNA que s\u00e3o cortadas em pequenos fragmentos). O eDNA total cont\u00e9m DNA celular originado de c\u00e9lulas ou organismos vivos e DNA extracelular resultante da morte celular natural e subsequente destrui\u00e7\u00e3o da estrutura celular.<\/p>

Microbiologistas t\u00eam analisado o eDNA do solo ou da \u00e1gua h\u00e1 mais de uma d\u00e9cada, o que lhes deu acesso \u00e0 gen\u00e9tica de microrganismos n\u00e3o cultiv\u00e1veis. Eles tinham tr\u00eas objetivos principais: (i) identificar t\u00e1xons microbianos presentes em amostras ambientais; (ii) identificar as fun\u00e7\u00f5es bioqu\u00edmicas mais importantes por meio da an\u00e1lise de genes codificadores; e (iii) montar genomas inteiros de microrganismos n\u00e3o cultiv\u00e1veis. A an\u00e1lise do eDNA por microbiologistas foi denominada metagen\u00f4mica, que apenas se referia \u00e0 montagem e an\u00e1lises funcionais (objetivos ii e iii) do eDNA de dados de sequ\u00eancias, mas n\u00e3o identifica\u00e7\u00f5es baseadas na amplifica\u00e7\u00e3o e sequencia\u00e7\u00e3o de genes marcadores como o 16S rDNA (objetivo i).<\/p>

Contudo, a utiliza\u00e7\u00e3o do eDNA passou a se disseminar principalmente a partir de 2011, com aprimoramentos constantes significativos a cada ano. A identifica\u00e7\u00e3o de t\u00e1xons baseada em DNA foi estendida para a invertebrados da meiofauna (por exemplo, nemat\u00f3ides) e para microrganismos, usando uma abordagem de PCR\/clonagem ou PCR\/sequenciamento de segunda gera\u00e7\u00e3o, isso j\u00e1 no in\u00edcio dos anos 2000, mas com o \u00fanico objetivo de identificar os diferentes organismos que contribu\u00edam com o DNA de uma determinada amostra.\u00a0<\/p>

Nos \u00faltimos anos, avan\u00e7os significativos est\u00e3o sendo alcan\u00e7ados nesta \u00e1rea de pesquisa. A coleta de amostras de eDNA realizadas em parques de saf\u00e1ri, jardins zool\u00f3gicos e fazendas, demonstraram que an\u00e1lises do DNA do solo podem ser usadas para registrar a presen\u00e7a de grandes mam\u00edferos. Invent\u00e1rios de minhocas feitos atrav\u00e9s de m\u00e9todos tradicionais consomem muito tempo e s\u00e3o muito complexos. Mas, uma tecnologia desenvolvida nos Alpes franceses e usando eDNA j\u00e1 permite que se trabalhe com comunidades de minhocas em qualquer parte do mundo.<\/p>

Claramente, o surgimento de eDNA em estudos ecol\u00f3gicos mais amplos est\u00e1 hoje ligado \u00e0 disponibilidade de sequenciadores de pr\u00f3xima gera\u00e7\u00e3o (NGS), que permitem contornar a etapa cara e demorada de clonagem e sequenciamento de produtos de PCR usando o sequenciamento Sanger.\u00a0N\u00e3o h\u00e1 d\u00favidas de que, a partir de agora, as an\u00e1lises de eDNA ser\u00e3o integradas a mais e mais estudos ecol\u00f3gicos. O sequenciamento de DNA, outrora uma t\u00e9cnica cara e demorada, tem se tornado cada vez mais r\u00e1pido, sens\u00edvel, e capaz de produzir quantidades cada vez maiores de dados gen\u00e9ticos. Por exemplo, um \u00fanico equipamento de alta performance de sequenciamento de DNA (Illumina HiSeq 250) possui hoje a mesma capacidade de produ\u00e7\u00e3o de dados que possu\u00edam conjuntamente todos os centros de pesquisa no mundo em 2006, sendo atualmente capaz de gerar 1 trilh\u00e3o de bases em uma \u00fanica corrida. Estes avan\u00e7os t\u00eam possibilitado oportunidades sem precedentes na detec\u00e7\u00e3o e monitoramento de esp\u00e9cies em ambientes silvestres.<\/p>

Uma potencial extens\u00e3o da abordagem de eDNA envolve a detec\u00e7\u00e3o de mais de uma esp\u00e9cie simultaneamente. No futuro, espera-se que as abordagens baseadas em eDNA possam ser utilizadas como marcador \u00fanico para an\u00e1lises de esp\u00e9cies ou de comunidades, atrav\u00e9s de pesquisas de metagen\u00f4mica, de ecossistemas inteiros, possibilitando a preven\u00e7\u00e3o dos padr\u00f5es de biodiversidade espaciais e temporais.<\/p>\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t<\/section>\n\t\t\t\t

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Por: Aline Horodesky O estudo de DNA ambiental (eDNA), est\u00e1 baseado na detec\u00e7\u00e3o de mol\u00e9culas de DNA produzidas como subproduto das atividades de uma determinada esp\u00e9cie, como aquelas encontradas em fezes, muco, saliva ou outra fonte de c\u00e9lulas mortas. M\u00e9todos de laborat\u00f3rio podem ser empregados para detectar e quantificar estas mol\u00e9culas, levando a diversos tipos […]<\/p>\n","protected":false},"author":920,"featured_media":13246,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"jnews-multi-image_gallery":[],"jnews_single_post":{"subtitle":"","format":"standard","video":"","gallery":"","source_name":"","source_url":"","via_name":"","via_url":"","override":[{"single_blog_custom":"","sidebar":"","second_sidebar":"","share_position":"","share_float_style":"","post_date_format":"","post_date_format_custom":"","post_reading_time_wpm":"","zoom_button_out_step":"1","zoom_button_in_step":"1","number_popup_post":"1"}],"image_override":[{"single_post_thumbnail_size":"","single_post_gallery_size":""}],"trending_post_position":"","trending_post_label":"","sponsored_post_label":"","sponsored_post_name":"","sponsored_post_url":"","sponsored_post_logo":"","sponsored_post_desc":""},"jnews_primary_category":{"id":""},"footnotes":""},"categories":[258],"tags":[],"class_list":["post-12855","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-divulgacao-cientifica"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/gia.org.br\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/12855","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/gia.org.br\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/gia.org.br\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/gia.org.br\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/users\/920"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/gia.org.br\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=12855"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/gia.org.br\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/12855\/revisions"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/gia.org.br\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/media\/13246"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/gia.org.br\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=12855"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/gia.org.br\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=12855"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/gia.org.br\/portal\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=12855"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}